71Биотехнология. Теория и практика. №1 2010
Материалы и методы
Поиск возможных белков для ис-
пользования в диагностической имму-
ноферментной тест-системе для диагнос-
тики ящура проводили с использо ванием
баз данных PubMed NCBI (http://www.
ncbi.n1m.nih.gov/pubmed) и GenBank NCBI
(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank).
Анализ первичных структур проводился
с использованием пакета программ
Vector NTI 9.0 (Informax, США). Синтез
производили фосфоамидитным способом
на автоматическом синтезаторе ASM-700
(BIOSSET, Россия).
В работе использовали штаммы
Е. coli DH5a и B834(DE3) (Novagen,
USA), плазмидные векторы pGEM-
TEasy (Promega, USA), pET15b и pET32a
(Novagen, США). Выделение плазмидной
ДНК, а также препаративное разделение
фрагментов ДНК проводили методами,
описанными Маниатисом с соавт. [2].
Для лигирования фрагментов ДНК
использовали ДНК-лигазу фага Т4
производства «Promega» (США). Первич-
ную структуру ДНК определяли по методу
Sanger [3] с использованием наборов BigDye
на автоматических анализаторах ДНК ABI
Prism 3100 (Applied Biosystems, США).
Наработка и очистка рекомбинантного
белка. Полученными плазмидами транс-
формировали компетентные клетки E.
coli штамма B834(DE3), трансформантов
высевали на селективную среду с ампи-
циллином (100 мкг/мл). Выросшими коло-
ниями инокулировали 100 мл среды 2xYT
(ампициллин 100 мкг/мл), культивировали
до OD
600
~ 0.8 при 37
o
C. Затем индуцировали
экспрессию гена добавлением IPTG до
концентрации 0,1 мМ. После добавления
индуктора температуру культивирования
снижали до 30
о
С и культивировали
индуцированную культуру 4-5 часов.
После этого клетки собирали центри-
фугированием (3000g 15’), промывали
небольшим объемом охлажденного буфера
(25 мМ натрий-фосфатный буфер рН 7.4,
400 мМ NaCl) и разрушали ультразвуком,
следуя рекомендациям производителя
прибора. Полученный лизат осветляли
центрифугированием (40 000g 45’). Реком-
бинантный белок очищали на колонке
HisTrap (Amersham) c использованием
хроматографической системы AktaFPLC
(Amersham).
Денатурирующий диск-электрофорез
белков проводили в вертикальной камере
(«Хеликон», Россия) в стеклах 10x8 см.
Нижний, разделяющий, гель имел размеры
5х8 см. При проведении электрофорезы
использовались гели и буферы следую-
щих составов. Разделяющий: 12% поли-
акриламид (акриламид: метилен бис-
акри ламид в соотношении 29:1); буфер
разде ляющего геля: 0,375М Трис-HCl
pH8,8; 0,1% SDS.
Концентрирующий гель: 5% поли ак-
риламид (акриламид: метиленбисак ри ламид
в соотношении 29:1); буфер разде ляющего
геля: 0,125М Трис-HCl pH6,8; 0,1% SDS.
Электродный буфер: 25 мМ Трис-
ОН; 250 мМ глицин; 0,1% SDS. Условия
проведения электрофореза: 25 мА на один
гель, разделение проводилось до выхода
красителя (бромфенолового синего) из геля.
результаты и обсуждение
Большинство из описанных в лите-
ратуре тест-систем для диагностики
ящура используют в качестве антигенов
неструктурные белки вируса ящура 3А,
3В, 3С. При этом, наиболее эффективным
является использование белка 3А, пос-
кольку он наиболее консервативен среди
неструктурных белков вируса [4, 5, 6, 7]. Более
того, обнаружение антител к неструктурным
белкам Lb, 2C, 3A или 3D, является сви-
детельством предыдущей инфекции FMD
вируса, с четким исключением некото рых
старых, многократно привитых живот ных
[8]. На основании изложенных данных,
мы предприняли сравнительный анализ
первичных структур известных последо-
вательностей гена неструктурного белка 3А
штаммов О и А.