20 Биотехнология. Теория и практика. №1 2010
наблюдаются случаи раннего РМЖ, в
соответствии с наследованием мутаций
высокого риска. Такие множественные
случаи РМЖ в пределах одной семьи дали
толчок к идентификации генов высокого
риска с использованием анализа сцепления
для определения маркеров, которые насле-
дуются сцепленно с заболеванием. Анализ
сцепления используется для карти рования
локуса, связанного с болезнью, через
исследование сцепления геномных марке-
ров с указанным фенотипом болез ней с
использованием образцов ДНК несколь-
ких членов больших семей. Область
генома вокруг сцепленных маркеров затем
допол нительно изучается с целью обнару-
жения причинных генов (позиционное
клонирование). Анализ сцепления подходит
для картиро вания высоко пенетрантных
генов предраспо ложенности к РМЖ, мута-
ции которых приводят к формированию
«раковых» семей, в которых большинство
членов, страдающих заболеванием, несут
мутации. Если ген имеет более низкую
пенетрант ность, корреляция между РМЖ
и мутацией в семьях с наличием мутаций
недостаточна для обнаружения сигнала
сцепления. Значительный сигнал также
трудно обнаружить, если РМЖ сцеплен с
опреде ленным локусом лишь в небольшой
части про анализированных семей.
Карты сцепления и наборы маркеров,
которые в достаточной степени обнаружены
в геноме человека, стали доступны в конце
1980-х годов. Использование больших
родословных семей с РМЖ, геномных
исследований позволили картировать гены
предрасположенности к РМЖ высокой
пенетрантности, предварительно пред ло-
женные анализами наследования, BRCA1
и BRCA2 [15, 16]. Анализы сцепления
также проводятся в группах фенотипически
различных семей для карти рования локусов,
связанных с развитием конкретных основных
синдромов, которые включают повышенный
риск развития РМЖ. Позиционное кло-
нирование, было затем использовано для
выявления причин ных генов, таких как
PTEN, STK11 и CDH1 [17-22].
Исследования по секвенированию
генов: скрининг мутаций в генах-
кандидатах
Во время 1990-х годов понимание
молекулярных механизмов патогенеза
РМЖ выявило возможные гены-кандидаты,
которые предрасполагают к РМЖ. Казалось
биологически правдоподобным, что белки,
взаимодействующие с BRCA1 и BRCA2, или
вовлеченные в процессы репарации ДНК,
могут быть вовлечены в восприимчивость
к РМЖ. Несколько патологических мутаций
было найдено с частотой, позволяющей
оценить их с помощью ассоциативных
иссле дований. Однако в большинстве
изу ченных генов репарации ДНК, вызы-
вающие болезнь мутации (в первую очередь
приводящие к преждевременной остановке
синтеза белка или nonsense мутации,
ведущие к угасанию РНК), встре чались
индивидуально очень редко. Надежная
демонстрация того, что такие гены
предрасполагают к РМЖ, вызвала необхо-
димость мутационного скрининга всей
кодирующей последовательности генов на
большом количестве случаев заболевания
и контроля в целях сравнить общее число
пато генных мутаций. Эксперименты такого
масштаба были опубликованы лишь для
нескольких генов репарации ДНК. Другие
гены, такие как вовлеченные в регуляцию
клеточного цикла, контроль чекпоинткиназ,
апоптоз, метаболизм стероидных гормонов,
на таком уровне были оценены реже.
Ассоциативные исследования
В ассоциативных исследованиях частота
указанного варианта сравнивается между
больными РМЖ и лицами контрольной
группы. Статистически значимые различия
в частоте аллелей между больными и лицами
контрольной группы более демонстративны
для вариантов с частотой в популяции >5%.
Поэтому ассоциативные исследования
наиболее подходят для идентификации
общих вариантов предрасположенности к
РМЖ.