Новиков Д.К. (и др.). Медицинская микробиология

Подождите немного. Документ загружается.

ПЕРЕЧЕНЬ УСЛОВНЫХ ОБОЗНАЧЕНИЙ

АГ – антиген(ы);

АДФ – аденозиндифосфат

АКДС – адсорбированная коклюшно-дифтерийно-столбнячная вакцина

цАМФ – циклический 3`-5`-аденозинмонофосфат

АТ – антитело(а)

АДФ – аденозиндифосфат

АТФ – аденозинтрифосфорная кислота

БГКП – бактерии группы кишечной палочки

ВИЧ – вирус иммунодефицита человека

ВИЭФ – встречный иммуноэлектрофорез

ЖКТ – желудочно-кишечный тракт

ЖСА – желточно-солевой агар

ИЛ – интерлейкин(ы)

ИФА – иммуноферментный анализ

КОЕ – колониеобразующие единицы

КУА – казеиново-угольный агар

ЛПС – липополисахарид

МБК – минимальная бактерицидная концентрация

МЖСА – молочно-желточно-солевой агар

МИК – минимальная ингибирующая концентрация

МПА – мясо-пептонный агар

МПБ – мясо-пептонный бульон

МПК – минимальная подавляющая концентрация

ПАБК – пара-аминобензойная кислота

ПАВ – поверхностно-активные вещества

ПЦР – полимеразная цепная реакция

ПЧЗТ – повышенная чувствительность замедленного типа

РА – реакция агглютинации

РИФ – реакция иммунной флюоресценции

РПГА – реакция пассивной гемагглютинации

РСК – реакция связывания комплемента

РТ – ретикулярные тельца

РТГА – реакция торможения гемагглютинации

СПИД – синдром приобретенного иммунного дефицита

СПМ – cанитарно-показательные микроорганизмы

ХТИ – химиотерапевтический индекс

ЦНС – центральная нервная система

ЦПМ – цитоплазматическая мембрана

ЭПКП – энтеропатогенные кишечные палочки

ЭТ – элементарные тельца

РАЗДЕЛ I. ОБЩАЯ МИКРОБИОЛОГИЯ

I. МИКРОБИОЛОГИЯ И ЕЕ РАЗВИТИЕ

Микробиология выделилась в самостоятельную научную дисциплину из поро-

дившей ее науки биологии. Любая отрасль знаний лишь тогда может считаться

наукой, когда она имеет свой предмет изучения и свои, присущие ей, методы иссле-

дования. Предметом изучения микробиологии является особый мир существ, неви-

димых невооруженным глазом, величина которых колеблется от нескольких нм до

0.1-1 мм. Отсюда возникло и название науки «Микробиология», которое состоит из

сочетания греческих слов micros - малый, bios - жизнь, logos - учение.

Таким образом микробиология является наукой, изучающей жизнь и разви-

тие мельчайших организмов – микроорганизмов – в их единстве со средой оби-

тания.

В связи с той огромной ролью, которую микроорганизмы играют в природе, за-

дачи микробиологии весьма многообразны. Происходит постоянная дифференциация

ее на самостоятельные научные разделы и дисциплины. В настоящее время самостоя-

тельное значение имеют общая микробиология – изучает общие закономерности

функционирования микроорганизмов, промышленная микробиология – важнейший

раздел современной биотехнологии, сельскохозяйственная микробиология, космиче-

ская микробиология, санитарная микробиология, ветеринарная микробиология и ме-

дицинская микробиология.

Предмет медицинской микробиологии – это болезнетворные (патогенные)

микроорганизмы, вызывающие заболевания у человека, а также непатогенные мик-

роорганизмы, находящиеся в организме человека и в окружающей среде и имеющие

значение для его здоровья.

Задачи медицинской микробиологии:

- диагностика с помощью микробиологических методов инфекционных заболе-

ваний, носительства, обнаружение патогенных возбудителей в организме и во внеш-

ней среде;

- санитарно-бактериологический контроль микробного загрязнения пищевых

продуктов, лекарственного сырья, воды, почвы, помещений и других объектов;

- разработка специфических препаратов для профилактики и лечения инфекци-

онных заболеваний.

В своем развитии микробиология прошла длительный и сложный, но весьма

успешный и плодотворный путь.

Начиная с ранних этапов становления науки, врачи и естествоиспытатели стре-

мились выяснить причины инфекционных болезней. Еще древние ученые Гиппократ,

Лукреций, Плиний, Гален высказывали гипотезы о живой природе возбудителей за-

разных заболеваний. Авиценна считал, что причиной возникновения заразных болез-

ней являются невидимые глазом мельчайшие живые существа, передающиеся через

воду и воздух.

Голландский ученый А. Левенгук (1632-1723) был первым, кто увидел и описал

микробы. С помощью простой лупы, дающей увеличение в 160-300 раз, он наблюдал

простейших, эритроциты, сперматозоиды. В 1678 г. А. Левенгук опубликовал письма

об animalcula viva – «живых зверьках», которых он обнаружил в воде, различных

настоях, испражнениях, зубном налете и зарисовал. В 1695 г. им издан труд «Тайны

природы, открытые Антонием Левенгуком». Этот период был чисто морфологиче-

ским, т.к. описывались лишь общая форма микроорганизмов.

Русский врач Д.С. Самойлович (1742-1810) высказал мысль о том, что «...чума

вызывается особливым и совсем отменным существом». Наблюдая за чумой, он при-

шел к выводу, что для предупреждения заболеваний следует вводить в организм

ослабленное заразное начало. Для доказательства правильности своего предположе-

ния, Самойлович самоотверженно произвел опаснейший опыт, привив себе в 1771 г.

заразный материал, взятый от человека, выздоравливающего от бубонной формы чу-

мы. Одна из главных научных заслуг Д.С. Самойловича – идея о возможности созда-

ния искусственного иммунитета против чумы с помощью прививок. За глубокое изу-

чение вопросов борьбы с чумой Д.С. Самойлович был избран почетным членом 12

западноевропейских академий наук.

В это же время (конец 18 – начало 19 в.в.) английский врач Э. Дженнер опубли-

ковал свои наблюдения о результатах прививок против оспы. Он доказал, что привив-

ки людям коровьей оспы предохраняют их от заражения натуральной оспой. Откры-

тие Э. Дженнера вооружило медицину могущественным средством для успешной

борьбы с этой болезнью.

В первой половине XIX века были выявлены первые микроорганизмы – возбуди-

тели инфекционных заболеваний. В 1839 г. И. Шенлейн установил, что фавус (парша)

вызывается болезнетворным грибом, в 1843 г. Д. Гурби обнаружил возбудителя три-

хофитии (стригущего лишая), в 1849-1854 гг. А. Поллендером, К. Давеном и

Ф.А. Брауэллем был описан возбудитель сибирской язвы.

Во второй половине XIX века появились более усовершенствованные микроско-

пы, намного улучшилась техника микроскопирования. В изучении микроорганизмов

стали уделять внимание биохимическим процессам – способности микробов фермен-

тировать органические вещества.

Второй период развития микробиологии как самостоятельной биологической

науки связан с именем гениального французского ученого, химика и микробиолога Л.

Пастера (1822-1895). Л. Пастер установил, что процессы брожения вызываются мик-

роорганизмами, причем каждый вид брожения – определенным видом. Им было вы-

яснено, что гниение – результат жизнедеятельности микроорганизмов. Большое зна-

чение имели работы Пастера о болезнях вина и пива, шелковичных червей, вызван-

ных микроорганизмами. Он предложил и метод их предупреждения, названный позд-

нее «пастеризацией» (прогревание при 60

С).

Исследования Пастера о возбудителях куриной холеры, сибирской язвы, бешен-

ства положили начало применению прививок.

Л. Пастер разработал методику исследований, обеспечивающую предохранение

питательных сред от попадания в них микробов.

Благодаря открытиям Пастера хирургия обогатилась совершенными методами

борьбы с нагноительными процессами ран. Английский хирург Д. Листер ввел в хи-

рургию принцип антисептики (обеззараживание ран химическими дезинфицирующи-

ми веществами).

Большое значение в развитии медицинской микробиологии имели открытия

немецкого ученого Р. Коха (1843-1910), который обогатил микробиологию более со-

вершенными методами исследования. Им и его учениками в практику лабораторной

техники были введены плотные питательные среды (картофель, желатин, свернутая

сыворотка, мясопептонный агар), анилиновые красители, иммерсионная система,

микрофотографирование, методика исследования микробов в живом виде, известная

под названием «висячая капля».

Р. Кох произвел подробное исследование раневых инфекций, разработал способ

выделения в чистой культуре патогенных бактерий. Исследования специфических

возбудителей позволили ему экспериментально подтвердить критерии развития ин-

фекционных болезней, ранее сформулированные Генле. В настоящее время они из-

вестны как «триада Генле-Коха»:

Должен быть обнаружен микроорганизм в каждом случае конкретного инфек-

ционного заболевания.

Такой микроорганизм не выявляется при других болезнях как случайный и не-

патогенный паразит.

После изоляции из организма больного и выделения чистой культуры патоген-

ный микроорганизм должен вызвать аналогичное заболевание у восприимчивого жи-

вотного.

Эти постулаты позволили конкретизировать инфекционные заболевания, хотя в

настоящее время стало ясно, что не все они соответствуют инфекциям человека (в

частности пункт 3).

Благодаря усовершенствованию техники и методики микробиологических ис-

следований, Р. Кох окончательно установил этиологию сибирской язвы (1876), от-

крыл возбудителей туберкулеза (1882), холеры (1883) и получил из культур туберку-

лезных микобактерий туберкулин (туберкулин Коха).

В ходе исторического развития микробиологии возникли и стали бурно разви-

ваться новые биологические науки – иммунология, вирусология, учение об антибио-

тиках.

Выдающийся русский ученый И.И. Мечников вместе с П. Эрлихом считается ос-

новоположником иммунологии. Кроме того, много внимания И.И. Мечников уделял

выяснению причин преждевременного старения и борьбе за долголетие человека. Им

было заложено начало учения об антагонизме микробов, впоследствии использован-

ного при получении антибиотиков. Совместно с французским микробиологом Э. Ру в

1903 г. И.И. Мечников разработал метод воспроизведения экспериментального сифи-

лиса.

И.И. Мечников был организатором первой в России бактериологической станции

в Одессе. Им была создана большая школа микробиологов (Г.Н. Габричевский, А.М.

Безредка, И.Г. Савченко, Л.А. Тарасевич, Н.Ф. Гамалея, Д.К. Заболотный, Н.Я. Чи-

стович и Ф.Я. Чистович).

В 1888 г. французские ученые Э. Ру и А. Иерсен установили, что возбудитель

дифтерии продуцирует биологический яд (токсин), и выяснили его значение в разви-

тии болезни. Немецкий ученый Э. Беринг (1890 г.) и японский исследователь С. Ки-

тазато путем повторных введений животным небольших доз столбнячного или диф-

терийного токсина изготовили соответствующие иммунные сыворотки, предохраня-

ющие животных от смертельного отравления токсинами. Э. Ру в институте Пастера

получил противодифтерийную сыворотку и применил ее для лечения детей, больных

дифтерией. В России противодифтерийная сыворотка была изготовлена Г.Н. Габри-

чевским в 1894 г.

Эти открытия послужили основой для приготовления лечебных сывороток про-

тив ботулизма, газовой анаэробной инфекции, укуса ядовитых змей и др.

Немецкий исследователь П. Эрлих (1854-1915) создал теорию гуморального им-

мунитета, вокруг которой возникла длительная и упорная борьба мнений, разделив-

шая ученых на два лагеря: сторонников П. Эрлиха и его противников во главе с И.И.

Мечниковым. Эта полемика вызвала бурный поток исследований вопросов иммуни-

тета и привела к большим практическим результатам: были разработаны более со-

вершенные лабораторные методы диагностики инфекционных болезней, получены

вакцины против брюшного тифа, холеры, чумы и других болезней. Благодаря широ-

кой дискуссии было установлено, что невосприимчивость к инфекционным заболева-

ниям зависит как от клеточного, так и от гуморального иммунитета. В 1908 г. за раз-

работку учения об иммунитете И.И. Мечникову и П. Эрлиху была присуждена Нобе-

левская премия.

12 февраля 1892 г. Д.И. Ивановский на заседании Российской Академии наук со-

общил, что возбудителем мозаичной болезни табака является фильтрующийся вирус.

Очень скоро выяснилось, что вирусы вызывают заболевания не только у растений, но

и у человека, животных, бактерий.

В ХХ веке были проведены весьма важные исследования в области специфиче-

ской профилактики заразных болезней. В 1924-1925 гг. Г. Рамон разработал метод из-

готовления анатоксинов (обезвреженных формалином токсинов), с помощью которых

стали успешно проводиться прививки против дифтерии и столбняка. Были получены

вакцинные препараты из живых, но ослабленных возбудителей против туберкулеза

(А. Кальметт и Ш. Герен, 1919), чумы (Г. Жирар и Ж. Робик, 1931), желтой лихорад-

ки (М. Тейлер, 1936), туляремии (Н.А. Гайский, Б.Я. Эльберт, 1939-1942), полиомие-

лита (А. Себин, 1954-1958).

Совершенствование уже известных бактериологических методов позволило вы-

делить новые патогенные бактерии – бледную спирохету, лептоспиры, боррелии,

риккетсии, хламидии и др. Были открыты фильтрующиеся инфекционные агенты –

вирусы, L-формы бактерий, микоплазмы. Более интенсивно развивались прикладные

аспекты иммунологии: были разработаны многие диагностические реакции (Вассер-

мана, Видаля, Вейля-Феликса и др.)

Второй важной вехой этого периода явились становление и первые сенсацион-

ные успехи химиотерапии инфекционных болезней. Ее основные принципы заложили

П.Л. Романовский и П. Эрлих, которого считают основоположником химиотерапии.

Первым истинно этиотропным препаратом явился сальварсан – 606-е производное

атоксила, изученное Эрлихом. Позднее были синтезированы синтетические аналоги

хинина, первые сульфаниламиды и антибиотики.

Создание электронного микроскопа сделало видимым мир вирусов и макромоле-

кулярных соединений. На бактериях О. Эвери, К. Маклеод и М. МакКарти доказали

роль ДНК в передаче наследственных признаков. Расшифровка основных принципов

кодирования генетической информации в ДНК бактерий, а также универсальность

генетического кода бактерий и вирусов позволили установить общие молекулярно-

генетические закономерности, свойственные высшим организмам. Расшифровка ге-

нома кишечной палочки сделала возможными искусственное конструирование генов

и пересадку отдельных генов из одних клеток в другие. Исследования в области мо-

лекулярной вирусологии показали способность вирусной ДНК встраиваться в геном

чувствительной клетки, а также позволили идентифицировать различные вирусы на

уровне молекулярной структуры.

Одновременно произошла существенная переоценка классических понятий в

иммунологии: возникли представления о структуре и функциях иммунной системы,

объединившие концепции инфекционной и неинфекционной иммунологии. Были

установлены основные популяции иммунокомпетентных клеток и их функции; выяс-

нены закономерности развития аутоиммунопатологии и иммунологической толерант-

ности. В медицинскую практику прочно вошли понятия об иммунодефицитах и реак-

циях гиперчувствительности. Восьмидесятые годы XX века завершились окончатель-

ным доказательством правоты клонально-селекционной теории генетического кон-

троля иммунных реакций, предложенной Ф. Бернетом в 1957 г.

На пороге XXI века микробиология составляет одно из основных направлений

медицины. В настоящее время ежегодно открывают два-три новых вида микроорга-

низмов. Спектр новых возбудителей достаточно широк и включает вирусы, бактерии,

грибы и паразитарные микроорганизмы.

Можно без преувеличения сказать, что в настоящее время нет ни одной меди-

цинской дисциплины, прогрессу которой не способствовали бы открытия в области

микробиологии.

Большая заслуга в развитии микробиологии принадлежит российским ученым.

Современник Л. Пастера и И.И. Мечникова Л.С. Ценковский в своих исследованиях

указал на сходство бактерий с микроскопическими сине-зелеными водорослями. В

1883 г. он получил высокоэффективную, устойчивую вакцину, которая в течение бо-

лее 60 лет использовалась для профилактики сибирской язвы среди сельскохозяй-

ственных животных.

В конце XIX века возникла сельскохозяйственная микробиология, основателем

которой был С.Н. Виноградский. В 1890 г. он открыл нитрифицирующие бактерии и

изучил их значение в круговороте азота в природе.

Большую роль сыграли русские ученые в развитии медицинской протозоологии.

Ф.А. Леш наблюдал в 1875 г. в испражнениях больного дизентерией амебы, которые

Ф. Шаудин идентифицировал как Entamoeba coli и Entamoeba histolytica. В 1898 г.

П.Ф. Боровский открыл возбудителя кожного лейшманиоза.

В 1892 г. ближайший сотрудник И.И. Мечникова Н.Ф. Гамалея (1859-1949) об-

наружил явление спонтанного растворения микробов, которое, как было установлено

Ф. д'Эреллем, обусловлено действием вируса бактерий – бактериофагом.

Под руководством И.И. Мечникова Н.Ф. Гамалея участвовал в создании первой

бактериологической станции в России и второй в мире пастеровской станции. Его ис-

следования посвящены изучению инфекции и иммунитета, изменчивости бактерий,

профилактике сыпного тифа, оспы, чумы и других болезней.

Деятельность многих русских исследователей характеризуется примерами само-

пожертвования как в научной, так и в практической работе. Исключительный героизм

проявили И.А. Деминский, М.А. Лебедева, В.И. Турчинович-Вижникевич, И.В. Мамон-

тов и др., которые заразились во время работы по изучению чумы и погибли от этой

инфекции.

В 1876 г. Г.Н. Минх и О.О. Мочутковский в опытах на самих себе установили за-

разность возвратного и сыпного тифа и пришли к заключению, что эти болезни пере-

даются кровососущими насекомыми.

Основоположнику московской микробиологической школы Г.Н. Габричевскому

(1860-1907) принадлежат труды по исследованию скарлатины, дифтерии, чумы и дру-

гих инфекций. Он организовал в Москве производство противодифтерийной сыво-

ротки и успешно применил ее для лечения детей, больных дифтерией.

Д.К. Заболотный (1866-1929), В.К. Высокович изучали эпидемиологию чумы.

Они доказали лечебное действие противочумной сыворотки, научно обосновали эпи-

демиологическую роль сурков в образовании природных очагов чумы; установили

токсическое действие сывороток крови больных сифилисом на трепонемы.

Марциновский Е. И. провел исследования по борьбе с малярией, лейшманиозом,

клещевым возвратным тифом, бруцеллезом, москитной лихорадкой; Л.А. Тарасевич

изучал механизм действия ферментов фагоцитов, эффективность прививок против

туберкулеза, методы борьбы с сыпным тифом и другими болезнями; И.Г. Савченко

исследовал вопросы иммунитета при сибирской язве, холере и возвратном тифе,

скарлатине и других инфекционных болезнях.

Зильбер Л.А. (1894-1966) с сотрудниками открыл вирус клещевого энцефалита и

разработал метод профилактики этого заболевания; им сформулирована вирусно-

генетическая теория происхождения злокачественных опухолей, исследованы меха-

низмы трансформации нормальных клеток в злокачественные, в частности интегра-

ции вирусных и клеточных геномов.

Ермольева З.В. (1898-1974) выяснила вопросы бактериофагии, профилактики хо-

леры, получила впервые в СССР пенициллин. П.Ф. Здродовский (1890-1976) внес

большой вклад в изучение механизмов развития малярии, бруцеллеза, менингококко-

вой инфекции, дифтерии, и особенно природноочаговых риккетсиозов; В.Д. Тимаков

(1905-1977) разработал средства и методы профилактики инфекционных болезней,

раскрыл проблемы генетики микроорганизмов, вопросы бактериофагии; им разрабо-

тан раздел, касающийся роли L-форм бактерий и микоплазм в инфекционной патоло-

гии людей.

Для развития микробиологии в Беларуси важное значение имело создание круп-

ных научных центров (Витебский химико-бактериологический институт, 1921; Мин-

ский пастеровский институт, 1924; кафедра микробиологии медицинского факультета

Белорусского государственного университета, 1923), расширение сети бактериологи-

ческих учреждений, формирование научных медицинских связей с учеными различ-

ных республик и зарубежных стран.

Серьезный вклад в развитие бактериологии, вирусологии, инфекционной имму-

нологии в Республике Беларусь внесли научные школы, созданные ведущими учены-

ми республики Б.Я. Эльбертом и В.И. Вотяковым. Впервые в мире Б.Я. Эльберт и

Н.А. Гайский разработали живую туляремийную вакцину и провели широкое испыта-

ние ее на людях (1936-1945); Б.Я. Эльбертом предложен новый способ накожного

применения живой туляремийной вакцины (1944), что намного упростило ее внедре-

ние в практику.

Ученым Беларуси принадлежит приоритет в комплексной разработке проблем

склеромы. Главными итогами проведенных исследований в 1920-30 г. (Б.Я. Эльберт,

В.М. Геркес и др.) были предложены схемы классификации и дифференциации кап-

сульных бактерий, изучение антигенной обособленности клебсиеллы склеромы, раз-

работка схемы бактериологической и серологической диагностики склеромы.

Микробиологи Беларуси совместно с клиницистами работали над актуальной

проблемой внутрибольничных инфекций и связанных с ней вопросами противомик-

робных мероприятий. Разработан микробиологический мониторинг за этиологиче-

ской структурой и лекарственной устойчивостью возбудителей внутрибольничных

инфекций, осуществляемый в хирургических и ожоговых отделениях больниц (А.П.

Красильников, А.А. Адарченко, Л.С. Змушко, 1971-1996).

Начиная с 1987 г., в Беларуси ведутся работы по исследованию эпидемиологии и

этиологии ВИЧ-инфекции. Белорусским НИИ эпидемиологии и микробиологии в

1989 г. впервые в СССР выделен высокопродуктивный штамм ВИЧ-1 zmb, зареги-

стрированный в Национальной коллекции вирусов в Институте вирусологии им. Д.И.

Ивановского. На основе его были разработаны диагностические препараты для имму-

ноферментного анализа и иммуноблотинга.

II. МОРФОЛОГИЯ МИКРООРГАНИЗМОВ

2.1. Систематика и номенклатура микроорганизмов

Мир микроорганизмов разнообразен и организмы в нем различаются по уровню

организации геномов, наличию и составу белоксинтезирующих систем и клеточной

стенки. В соответствии с этими признаками микроорганизмы делят на 3 надцарства:

эукариоты, прокариоты, вирусы.

Микроорганизмы – это невидимые простым глазом представители всех царств

(бактерии, грибы, простейшие, сине-зеленые водоросли, вирусы). Они занимают низ-

шие ступени эволюции, но играют важную роль в существовании и развитии приро-

ды, в круговороте веществ, в патологии человека, животных и растений.

Эукариоты имеют дифференцированное ядро, отграниченное от цитоплазмы

ядерной мембраной, аппарат митоза и ядрышко. К эукариотам относятся простейшие,

дрожжи и нитчатые грибы.

Ядерная ДНК эукариотов находится в комплексе с гистонами в соотношении 1:1,

хромосомы построены в виде нуклеосом, состоящих из белковых глобул, и фрагмента

ДНК размером в 200 пар нуклеотидов. Эукариоты имеют рибосомы 80S, митохондрии

или хлоропласты, не содержат пептидогликана, являются аэробами.

Прокариоты – это организмы, у которых нет оформленного ядра, а есть эквива-

лент ядра – нуклеоид, который представлен одной или несколькими хромосомами,

расположенными в цитоплазме и не отграниченными от нее никакой мембра-

ной. Прокариоты не имеют дифференцированного аппарата митоза, у них нет ядрыш-

ка. Они имеют рибосомы 70S, клеточную стенку, содержащую пептидогли-

кан. Размеры прокариотов колеблются от 1 до 20 мкм, у них нет митохондрий и хло-

ропластов. Среди прокариотов есть аэробные и анаэробные организмы.

К вирусам относят организмы, у которых геном представлен ДНК или РНК, от-

сутствуют белоксинтезирующие системы, вирусы являются абсолютными внутрикле-

точными паразитами.

Систематика микроорганизмов занимается подробным описанием видов орга-

низмов, выяснением степени родства между ними, объединением их по уровню род-

ства в классификационные единицы – таксоны. Отсюда таксономия – это наука о

принципах и методах распределения организмов в иерархическом плане.

Классификация – составная часть систематики, она распределяет микроорганиз-

мы по различным таксонам.

Основной таксономической единицей является вид.

Вид – это эволюционно сложившаяся совокупность микроорганизмов, имеющих

единое происхождение, сходный генотип, среду обитания и свойства, а также спо-

собность вызывать сходные процессы в организме человека или внешней среде.

Последующие более крупные таксономические единицы: род, семейство, поря-

док, класс, отдел, царство.

В настоящее время в микробиологии для классификации используется несколько

основных способов.

1. Нумерический подход.

Он основан на оценке степени сходства и различия организмов по максимально

возможному количеству фенотипических свойств и проявлений. Иногда проводят

оценку более 100 показателей. Для увеличения достоверности определения признакам

присваиваются коэффициенты (их еще называют весом). Чем более важен данный

признак для определения возбудителя, чем реже он встречается у других микроорга-

низмов, тем выше вес признака и тем специфичнее он определяет данного возбудите-

ля (например, продукция плазмокоагулазы у золотистого стафилококка).

2. Генетический подход.

Он основан на сходстве в строении ДНК геномов изучаемых бактерий.

Считается, что микроорганизмы, принадлежащие к 1 виду, обладают от 70 до

100% гомологией ДНК. При 60% совпадении речь может идти о принадлежности

бактерий к 1 роду.

Для генетической классификации используют метод гибридизации нуклеиновых

кислот, изучают процентное содержание гуанина и цитозина в ДНК генома, опреде-

ляют молекулярный вес ДНК, наличие плазмид. В последнее время, особенно для

внутривидовой дифференциации микроорганизмов, используют метод полимеразной

цепной реакции.

3. Типирование по рибосомальной РНК (риботипирование).

Оказалось, что рибосомальная РНК бактерий содержит высококонсервативные

последовательности, которые в процессе эволюции изменялись незначительно. Раз-

личия в структуре рибосомальной РНК позволяют дифференцировать крупные таксо-

ны (порядки, классы, семейства) у бактерий.

Генетические механизмы, лежащие в основе изменчивости микроорганизмов,

обеспечивают только относительную стабильность признаков, которые в пределах

одного и того же вида могут варьировать. Отсюда сложилось понятие о вариантах

(типах) микроорганизмов, отличающихся отдельными признаками от стандартных

видов. Так, различают: морфологические (морфовары), биологические (биовары),

ферментативные (ферментовары), различные по резистентности к антибиотикам (ре-

зистенсвары) и бактериофагам (фаговары) варианты бактерий. Наряду с этим отдель-

ные виды могут включать варианты, различающиеся по антигенной структуре (серо-

вары), экологическим нишам, в которых они обитают (эковары) и патогенности для

определенных хозяев (патовары).

Штаммом называют культуру одного вида микроорганизмов, выделенную из

различных источников (организма человека, животного, окружающей среды) или из

одного и того же источника, но в разное время. Обычно штаммы обозначают прото-

кольными номерами или называют либо по источнику выделения (водный, кишеч-

ный), либо по местности, где он был выделен. Штаммы микробов одного вида могут

быть совершенно идентичными или различаться по степени вирулентности, метабо-

лической активности, чувствительности к антибиотикам и антисептикам, однако

свойства отдельных штаммов не выходят за пределы данного вида микроорганизмов.

Согласно биноминальной номенклатуре каждый микроорганизм имеет название,

состоящее из двух слов: первое слово означает род и пишется с прописной буквы,

второе слово означает вид и пишется со строчной буквы, например Escherichia

coli. Возможно сокращение рода до первой буквы, реже встречаются сокращения до