Сетубал Ж., Мейданис Ж. Введение в вычислительную молекулярную биологию

Москва; Ижевск: НИЦ "Регулярная и хаотическая динамика", Институт компьютерных исследований, 2007. — 420 с. Настоящая книга представляет собой введение в вычислительную молекулярную биологию, описывает наиболее типичные ее задачи и предлагает эффективные алгоритмы их решения. Книга начинается с обзора фундаментальных понятий молекулярной биологии (в том числе структура и функции белков и нуклеиновых кислот, механизмы молекулярной генетики), далее вводятся важнейшие математические объекты, такие как графы и строки, и приводятся общие сведения об алгоритмах. Все это подготавливает почву для понимания дальнейших разделов книги: сравнение последовательностей (и поиск в базе данных), сборка фрагментов ДНК, составление физических карт ДНК, филогенетические деревья, перестройка генов, предсказание структуры макромолекулы и вычисления с помощью ДНК. Каждый из этих разделов содержит обсуждение биологических предпосылок, определения ключевых терминов, полное описание применяемых математических или компьютерных моделей, а также примеры реализации алгоритмов. Книга предназначена для программистов, математиков и биологов, стремящихся расширить свои познания в этой новой захватывающей области наук, где еще так много нерешенных задач.