Биоинформатика

Полесгу,Пинск Юрченко Е.О, 2016г, экзамен 5 курс, 50 вопросов Основные исторические вехи в развитии биоинформатики. Значение и основные задачи биоинформатики. Основные разделы биоинформатики.Объекты биоинформатики. Пути передачи молекулярно-биологической информации в живой системе. Свойства биоинформационных данных.Компьютерные дисциплины, применяемые в биоинформатике. Основные модели баз данных.Принципы поисковых систем: индексирование, запросы...

Томск: ТМЛ-Пресс, 2007. — 304 с. Учебное пособие представляет собой руководство по применению информационных технологий в ботанических исследованиях. Излагается ретроспективный обзор прикладных программ ботанического профиля, построенных на основе систем управления базами данных, приводится описание компьютерных интерпретаций традиционных методов обработки ботанического материала; предлагаются новые подходы в обработке флористических и геоботанич...

Петрозаводск: Изд-во ПетрГУ, 2007. - 76 с. Пособие содержит описание принципов и этапов обработки данных на компьютере с помощью программ MS Excel и StatGraphics Plus 2.1. На конкретных примерах рассмотрены основные методы статистической обработки, необходимые при проведении биолого-экологических исследований, начиная с описательной статистики и заканчивая компонентным анализом. Особое внимание уделено построению уравнений регрессии и аппроксима...

Статья. Опубликована в электронном журнале BioDat, 2012, 13 с. . В статье рассмотрены вопросы связи информации и биологии.

Харьков: НТУ «ХПИ», 2015. – 80 с. – ISBN 978-617-05-0141-7 Учебно-методическое пособие содержит материалы по основным вопросам курсов «Биоинформатика и информационная биотехнология» и «Биоинформатика и фармакоинформатика», необходимым для самостоятельного решения задач по выравниванию белковых последовательностей. Предназначено для студентов специальностей биотехнологического профиля всех форм обучения. Содержание Выравнивание биологических посл...

М.: ВИНИТИ, 1977. — 111 с. — ISBN: N/A Термином «возбудимые среды» принято обозначать совокупность большого числа тел или иначе организованных возбудимых клеток. В зависимости от организации межклеточных связей различают возбудимые среды двух типов — синцитии и нейронные сети. Синцитии характеризуются тем, что электрическое сопротивление в области межклеточных контактов мало и отдельные клетки взаимодействуют только с ближайшими соседями. Для ней...

Доклад на 19-м заседании семинара «Методологические проблемы наук об информации» (Москва, ИНИОН РАН), Каменская М.А., 2014 г., 23 стр. Введение. Сущность Живого (Жизни). Биологические системы. Искусственные информационные системы. Информационный подход в биологии. Биологическая информация. Нейрологическая информация. Информационная функция нейроиммуноэндокринной системы в организме позвоночных животных. Биологическая информация как аналогия или м...

Учебное пособие. - Санкт-Петербург: НИУ ИТМО, 2012. - 62 с. BioPERL - это набор PERL-модулей, которые используются при разработке скриптов для приложений в области биоинформатики. В учебном пособии приведены основные конструкции BioPERL, рассмотрены решения типовых задач и методы работы с удаленными и локальными данными. Приведены примеры скриптов и модулей. Для студентов дневного отделения специальности 230201.65 "Информационные системы и технол...

Учебно-методическое пособие. - Санкт-Петербург: НИУ ИТМО, 2012. - 52 с. В учебно-методическом пособии приведены лабораторные работы по биоинформатике, описание их пошагового выполнения, вопросы для самоконтроля и последовательности, необходимые при выполнении лабораторных работ. Для студентов дневного отделения специальности 230201.65 "Информационные системы и технологии", 240700 "Биотехнология".

Московский Государственный Университет им М.В. Ломоносова, Факультет Биоинженерии и Биоинформатики, Москва, 2003 г., 28 с. Выполнили Каргин В.И., Страшнов П.В. Список используемых сокращений Введение Литературный обзор Семейство GFP-подобных белков Флуоресценция. Механизм флуоресценции Образование хромофора Материалы и методы Программное обеспечение Методика оптимизации белковых структур Подготовка файлов Геометрическая оптимизация и молекулярная...

Учебно-методическое пособие. - Иркутск: Иркутский гос. ун-т, 2011. - 50 с. Учебно-методическое пособие содержит примеры использования современных веб- и интернет-сервисов для решения возникающих перед биологом биоинформатических задач. В нем освещены общие вопросы работы с биологическими последовательностями и пространственными моделями, кратко описаны применяющиеся в биоинформатике форматы файлов, содержится обзор основных биологических баз дан...

Учебное пособие. Издание 2-е исправленное - М.: ФГОУ ВПО РГАУ - МСХА им. К.А. Тимирязева, 2013. - 120 с. ISBN 978-5-9675-0214-9 В учебном пособии изложены методические основы биоинформатики - генетико- математические модели, методы, алгоритмы и компьютерный сервис. Рассмотрены основные задачи биоинформатики, ее значение для геномики растений, молекулярная филогенетика, выравнивание последовательностей, анализ вторичной структуры РНК и белков. Пос...

World Scientific Publishing Company, 2011, 504 pages The purpose of this proceedings volume is to return to the starting point of bio-informatics and quantum information, fields that are growing rapidly at present, and to seriously attempt mutual interaction between the two, with a view to enumerating and solving the many fundamental problems they entail. For such a purpose, we look for interdisciplinary bridges in mathematics, physics, informa...

Wiley-Interscience, 2001. - 488 Pages. With the advent of the new millenium, the scientific community marked a significant milestone in the study of biology—the completion of the ‘‘working draft’’ of the human genome. This work, which was chronicled in special editions of Nature and Science in early 2001, signals a new beginning for modern biology, one in which the majority of biological and biomedical research would be conducted in a ‘‘sequence...

Издательство Prentice Hall, 2002, -395 pp. Bioinformatics Computing is a practical guide to computing in the burgeoning field of bioinformatics—the study of how information is represented and transmitted in biological systems, starting at the molecular level. This book, which is intended for molecular biologists at all levels of training and practice, assumes the reader is computer literate with modest computer skills, but has little or no forma...

Springer, 2005. - 396 pages. Solving modern biological problems requires advanced computational methods. Bioinformatics evolved from the active interaction of two fast-developing disciplines, biology and information technology. The central issue of this emerging field is the transformation of often distributed and unstructured biological data into meaningful information. This book describes the application of well-established concepts and techn...

2nd Edition. Wiley Publishing, Inc., 2007. – 457 pages. Bioinformatics is about searching biological databases, comparing sequences, looking at protein structures, and (more generally) asking biological and biomedical questions with a computer. The bioinformatics we show you in this book can save you months of work in the lab at the minute cost of a few hours’ work with your computer. Although you’ll find standard biological terms throughout, don...

Wiley-Interscience, 2011. - 298 pages. Mathematics of Bioinformatics: Theory, Methods, and Applications provides a comprehensive format for connecting and integrating information derived from mathematical methods and applying it to the understanding of biological sequences, structures, and networks. Each chapter is divided into a number of sections based on the bioinformatics topics and related mathematical theory and methods. Each topic of the...

Geneticists needs bioinformatics. This is particularly true of those trying to identify and understand genes that influence complex phenotypes. These specialists are required to support a dauntingly wide assortment of applications: typical queries for such people might range from how to find instructions for accessing the internet, to how to disentangle a complex database schema, to how to optimize numerically intensive algorithms on parallel com...

Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2001 Книга на английском написана в первую очередь для биологов, которые хотят понимать метод последовательностей и структурного анализа. Также одна из главных задач автора - помочь биологам оценить алгоритмы, используемые в модели.

Morgan Kaufmann Publishers, 2009. - 400 pages. The Bayesian network is one of the most important architectures for representing and reasoning with multivariate probability distributions. When used in conjunction with specialized informatics, possibilities of real-world applications are achieved. Probabilistic Methods for BioInformatics explains the application of probability and statistics, in particular Bayesian networks, to genetics. This book...

Berlin, Heidelberg: Springer-Verlag, 2007. — 342 p. Современное руководство по общей биологии, написанное английскими авторами. Весь материал изложен на весьма высоком уровне, но простота изложения и удачное расположение тем делают его доступным для неподготовленного читателя. This volume is a senior undergraduate-or graduate-level textbook on bioinformatics, which also can be treated as a short monograph. It is focused on the mathematical and co...

Springer, 2008. - 445 pages. Bioinformatics is an interdisciplinary science which involves molecular biology, molecular chemistry, physics, mathematics, computational sciences, etc. Most of the books on biomathematics published within the past ten years have consisted of collections of standard bioinformatics problems and informational methods, and focus mainly on the logistics of implementing and making use of various websites, databases, softw...

InTech. 2011. 190 p. This book consists of nine chapters covering a variety of bioinformatics subjects, ranging from database resources for protein allergens, unravelling genetic determinants of complex disorders, characterization and prediction of regulatory motifs, computational methods for identifying the best classifiers and key disease genes in large-scale transcriptomic and proteomic experiments, functional characterization of inherently u...