153
Принцип устройства компьютерной ДНК-памяти осно-
ван на последовательном соединении четырех нуклеотидов (ос-
новных кирпичиков ДНК-цепи). Три нуклеотида, соединяясь в
любой последовательности, образуют элементарную ячейку памя-
ти - кодон, которые затем формируют цепь ДНК. Основная труд-
ность в разработке ДНК-компьютеров связана с проведением из-
бирательных однокодонных реакций (взаимодействий) внутри це
-
пи ДНК. Однако прогресс есть уже и в этом направлении. Уже
есть экспериментальное оборудование, позволяющее работать с
одним из 1020 кодонов или молекул ДНК. Другой проблемой яв-
ляется самосборка ДНК, приводящая к потере информации. Ее
преодолевают введением в клетку специальных ингибиторов - ве-
ществ, предотвращающих химическую реакцию самосшивки.
Использование молекул DNA для организации
вычислений
– это не слишком новая идея. Теоретическое обоснование подоб-
ной возможности было сделано еще в 50-х годах прошлого века
(Р.П. Фейманом). В деталях эта теория была проработана в 70-х
годах Ч. Бенеттом и в 80-х М. Конрадом.
Первый компьютер на базе ДНК был создан еще в 1994 г.
американским ученым
Леонардом Адлеманом. Он смешал в про-
бирке молекулу ДНК, в которой были закодированы исходные
данные, и специальным образом подобранные ферменты. В ре-
зультате химической реакции структура ДНК изменилась таким
образом, что в ней в закодированном виде был представлен ответ
задачи. Поскольку вычисления проводились в ходе химической
реакции с участием ферментов,
на них было затрачено очень мало
времени.
Ричард Липтон из Принстона первым показал, как, исполь-
зуя ДНК, кодировать двоичные числа и решать проблему удовле-
творения логического выражения. Суть ее в том, что, имея некото-
рое логическое выражение, включающее n логических перемен-
ных, нужно найти все комбинации значений переменных, делаю-
щих выражение
истинным. Задачу можно решить только перебо-
ром 2n комбинаций. Все эти комбинации легко закодировать с по-
мощью ДНК, а дальше действовать по методике Адлемана.
Первую модель биокомпьютера, правда, в виде механизма
из пластмассы, в 1999 г. создал Ихуд Шапиро из Вейцмановского