ПолесГУ, экзамен, 60 вопросов
Организация геномов различных групп организмов. Корреляция сложности организации организма с размером генома.
Эволюция геномов. Роль геномных перестроек, увеличения и уменьшения размеров геномов, роль мобильных генетических элементов в этих процессах.
Семейства гомологичных генов в геномах. Ортологи и и паралоги. Псевдогены. Типы повторяющихся последовательностей и их встречаемость в геномах различных организмов.
Организация хромосом различных организмов. Теломераза, механизм репликации концов линейных хромосом.
Структура прерывистых генов у различных эукариот: размеры и число интронов и экзонов, взаимосвязь организации генов с различиями в механизме их экспрессии у растений и животных.
ДНК-полимеразы прокариот: размеры, субъединичный состав, ферментативные активности и участие в процессах репликации и репарации.
Структура ДНК-полимеразы III кишечной палочки, функции ее отдельных субъединиц.
ДНК-полимеразы эукариот: размеры, субъединичный состав, ферментативные активности и участие в процессах репликации и репарации.
Модель работы димерной полимеразы; координация синтеза ДНК на комплементарных нитях.
Роль вспомогательных белков (ДСБ, хеликаз, праймаз и лигаз) в синтезе ДНК. Полунепрерывный синтез и фрагменты Оказаки.
Регуляция инициации репликации у E. сoli. Структура участка старта репликации (OriС). Понятие о репликоне. Терминация репликации у бактерий.
Репликоны у эукариот. Ori у дрожжей, их структурно-функциональная организация. Принципы контроля инициации репликации у эукариот.
Схема синтеза ДНК в репликативной вилке у прокариот.
Топологические проблемы, связанные с репликацией ДНК. Топоизомеразы I и II типов, механизм их действия.
Основные типы повреждений ДНК. Спонтанные и индуцируемые повреждения.
Репарация повреждений ДНК. Фотореактивация.
Эксцизионная репарация (эксцизия нуклеотидов, оснований): используемые ферменты и их функции.
Пострепликативная репарация. Роль метилирования в дискриминации цепей ДНК после репликации.
Рекомбинационная репарация.
SOS-репарация. Белки Rec А и Lex А.
Рекомбинация. Общая и сайтспецифическая рекомбинация, механизмы.
Основные типы мобильных генетических элементов про- и эукариот: структура, гены и их продукты. Молекулярный механизм транспозиции.
Общая схема транскрипции у прокариот. Единица транскрипции. Стадии транскрипционного цикла.
Особенности структуры РНК-полимеразы прокариот. Кор-фермент и холофермент.
Промотор прокариот, его структура и механизм его распознавания. Позитивные регуляторы.
Терминация транскрипции у прокариот. Rho-зависимая и независимая терминация транскрипции у прокариот. ПАСЬ
Транскрипция у эукариот. РНК-полимеразы I, II и III эукариот, функции основных субъединиц.
Промоторы эукариот: размеры, положение, структура, механизм распознавания РНК-полимеразами. Структура промотора для РНК-полимеразы П.
Транскрипционные факторы эукариот. Инициаторные комплексы на промоторах различных РНК-полимераз.
Терминация транскриптов эукариотических РНК-полимераз.
Общий план строения РНК.
Первичные продукты транскрипции, их характеристика. ПРОВОТОРОВА
Определение процессинга. Интроны группы I. Особенности структуры и механизмы сплайсинга. Аутосплайсинг. Реакция трансэтерификации.
Рибозимы, их специфичность, механизм катализа. Примеры рибозимов (L-19 РНК, РНКаза Р, «головка молотка»).
Интроны группы П: структура и механизм сплайсинга. ШТЫК
Сплайсинг пре-мРНК в ядре. Сплайсосома. мяРНК и мяРНП-частицы.
Альтернативный сплайсинг: механизмы, роль, распространение, примеры.
Процессинг пре-мРНК. Модификация 5′ и 3′-концов транскрипта. Значение модификации концов транскриптов. Различный эффект полиаденилирования у прокариот и эукариот.
мРНК, ее структура и функциональные участки. ЯКУБОВСКАЯ
Процессинг пре-тРНК: формирование 5′ и 3′-концов тРНК, сплайсинг, модификация оснований.
Рибосомальные РНК. Процессинг пре-рРНК у прокариот и эукариот.
Общая схема биосинтеза белков. ЯКУБОВСКАЯ
Генетический код. Основные свойства генетического кода.
Транспортные РНК: первичная, вторичная и третичная структура, роль модифицированных нуклеотидов. Аминоацилирование тРНК. ГЛАДУН
Прокариотический и эукариотический типы рибосом. Рибосомные РНК и белки, их виды и номенклатура.
Функциональные участки рибосом: мРНК-связывающий участок, тРНК-связывающие участки А, Р и Е участки, пептидилтрансферазный участок.
Инициация трансляции у прокариот. Инициирующие кодоны и сайт связывания рибосом на мРНК. Инициаторная тРНК и белковые факторы инициации.
Инициация трансляции у эукариот. Особенности эукариотической мРНК. Кэп-структура и инициирующие кодоны. Инициаторная тРНК. Белковые факторы инициации.
Элонгация полипептидной цепи. Фактор элонгации 1 EF-Tu или EF-1) и поступление аминоацил-тРНК в рибосому. Реакция транспептидации.
Фактор элонгации 2 (EF-G или EF-2) и транслокация рибосомы.
Терминация трансляции: терминирующие кодоны, белковые факторы терминации (RF1, RF, RF3), гидролиз пептидил-тРНК. Фактор RRF и диссоциация трансляционного комплекса.
Фолдинг белков. Формирование нативной трехмерной структуры белков. Молекулярные шрпероны семейств Hsp60 и Hsp70 у про- и эукариот.
Рабочий цикл шаперонных комплексов CroELS и DnaKJ-GrpE.
Деградация белков: АТФ-зависимые протеазы прокариот и 26S-протеасома эукариот.
Механизм распознавания аномальных белков. Система убиквитинилирования белков эукариот.
Секреция белков у прокариот. Sec-аппарат и сигнальный пептид, системы секреции I-IV типов.
Распределение белков по компартментам клетки эукариот. Котрансляционная транслокация белков в полость эндоплазматического ретикулума.
Модификации белков в полости эндоплазматического ретикулума.
Транспорт белков в митохондрии и хлоропласты, контроль локализации белков внутри этих органелл.
Транспорт белков через ядерные поры.
Организация геномов различных групп организмов. Корреляция сложности организации организма с размером генома.
Эволюция геномов. Роль геномных перестроек, увеличения и уменьшения размеров геномов, роль мобильных генетических элементов в этих процессах.
Семейства гомологичных генов в геномах. Ортологи и и паралоги. Псевдогены. Типы повторяющихся последовательностей и их встречаемость в геномах различных организмов.
Организация хромосом различных организмов. Теломераза, механизм репликации концов линейных хромосом.
Структура прерывистых генов у различных эукариот: размеры и число интронов и экзонов, взаимосвязь организации генов с различиями в механизме их экспрессии у растений и животных.
ДНК-полимеразы прокариот: размеры, субъединичный состав, ферментативные активности и участие в процессах репликации и репарации.
Структура ДНК-полимеразы III кишечной палочки, функции ее отдельных субъединиц.
ДНК-полимеразы эукариот: размеры, субъединичный состав, ферментативные активности и участие в процессах репликации и репарации.
Модель работы димерной полимеразы; координация синтеза ДНК на комплементарных нитях.
Роль вспомогательных белков (ДСБ, хеликаз, праймаз и лигаз) в синтезе ДНК. Полунепрерывный синтез и фрагменты Оказаки.
Регуляция инициации репликации у E. сoli. Структура участка старта репликации (OriС). Понятие о репликоне. Терминация репликации у бактерий.
Репликоны у эукариот. Ori у дрожжей, их структурно-функциональная организация. Принципы контроля инициации репликации у эукариот.
Схема синтеза ДНК в репликативной вилке у прокариот.
Топологические проблемы, связанные с репликацией ДНК. Топоизомеразы I и II типов, механизм их действия.
Основные типы повреждений ДНК. Спонтанные и индуцируемые повреждения.
Репарация повреждений ДНК. Фотореактивация.
Эксцизионная репарация (эксцизия нуклеотидов, оснований): используемые ферменты и их функции.
Пострепликативная репарация. Роль метилирования в дискриминации цепей ДНК после репликации.
Рекомбинационная репарация.
SOS-репарация. Белки Rec А и Lex А.
Рекомбинация. Общая и сайтспецифическая рекомбинация, механизмы.
Основные типы мобильных генетических элементов про- и эукариот: структура, гены и их продукты. Молекулярный механизм транспозиции.
Общая схема транскрипции у прокариот. Единица транскрипции. Стадии транскрипционного цикла.
Особенности структуры РНК-полимеразы прокариот. Кор-фермент и холофермент.
Промотор прокариот, его структура и механизм его распознавания. Позитивные регуляторы.
Терминация транскрипции у прокариот. Rho-зависимая и независимая терминация транскрипции у прокариот. ПАСЬ
Транскрипция у эукариот. РНК-полимеразы I, II и III эукариот, функции основных субъединиц.
Промоторы эукариот: размеры, положение, структура, механизм распознавания РНК-полимеразами. Структура промотора для РНК-полимеразы П.
Транскрипционные факторы эукариот. Инициаторные комплексы на промоторах различных РНК-полимераз.
Терминация транскриптов эукариотических РНК-полимераз.
Общий план строения РНК.
Первичные продукты транскрипции, их характеристика. ПРОВОТОРОВА
Определение процессинга. Интроны группы I. Особенности структуры и механизмы сплайсинга. Аутосплайсинг. Реакция трансэтерификации.
Рибозимы, их специфичность, механизм катализа. Примеры рибозимов (L-19 РНК, РНКаза Р, «головка молотка»).
Интроны группы П: структура и механизм сплайсинга. ШТЫК
Сплайсинг пре-мРНК в ядре. Сплайсосома. мяРНК и мяРНП-частицы.
Альтернативный сплайсинг: механизмы, роль, распространение, примеры.
Процессинг пре-мРНК. Модификация 5′ и 3′-концов транскрипта. Значение модификации концов транскриптов. Различный эффект полиаденилирования у прокариот и эукариот.
мРНК, ее структура и функциональные участки. ЯКУБОВСКАЯ
Процессинг пре-тРНК: формирование 5′ и 3′-концов тРНК, сплайсинг, модификация оснований.
Рибосомальные РНК. Процессинг пре-рРНК у прокариот и эукариот.
Общая схема биосинтеза белков. ЯКУБОВСКАЯ
Генетический код. Основные свойства генетического кода.
Транспортные РНК: первичная, вторичная и третичная структура, роль модифицированных нуклеотидов. Аминоацилирование тРНК. ГЛАДУН
Прокариотический и эукариотический типы рибосом. Рибосомные РНК и белки, их виды и номенклатура.
Функциональные участки рибосом: мРНК-связывающий участок, тРНК-связывающие участки А, Р и Е участки, пептидилтрансферазный участок.
Инициация трансляции у прокариот. Инициирующие кодоны и сайт связывания рибосом на мРНК. Инициаторная тРНК и белковые факторы инициации.
Инициация трансляции у эукариот. Особенности эукариотической мРНК. Кэп-структура и инициирующие кодоны. Инициаторная тРНК. Белковые факторы инициации.
Элонгация полипептидной цепи. Фактор элонгации 1 EF-Tu или EF-1) и поступление аминоацил-тРНК в рибосому. Реакция транспептидации.
Фактор элонгации 2 (EF-G или EF-2) и транслокация рибосомы.
Терминация трансляции: терминирующие кодоны, белковые факторы терминации (RF1, RF, RF3), гидролиз пептидил-тРНК. Фактор RRF и диссоциация трансляционного комплекса.
Фолдинг белков. Формирование нативной трехмерной структуры белков. Молекулярные шрпероны семейств Hsp60 и Hsp70 у про- и эукариот.
Рабочий цикл шаперонных комплексов CroELS и DnaKJ-GrpE.
Деградация белков: АТФ-зависимые протеазы прокариот и 26S-протеасома эукариот.
Механизм распознавания аномальных белков. Система убиквитинилирования белков эукариот.
Секреция белков у прокариот. Sec-аппарат и сигнальный пептид, системы секреции I-IV типов.
Распределение белков по компартментам клетки эукариот. Котрансляционная транслокация белков в полость эндоплазматического ретикулума.
Модификации белков в полости эндоплазматического ретикулума.
Транспорт белков в митохондрии и хлоропласты, контроль локализации белков внутри этих органелл.
Транспорт белков через ядерные поры.