Двумерная флуоресцентная микроскопия для анализа биологических образцов 68
2.6. Флуоресцентная гибридизация in situ............................................................ 28
Протокол 2.6.1. Обработка стекол аминопропилтриэтоксисиланом .. 29
Протокол 2.6.2. Получение препаратов метафазных хромосом из
культуры клеток фибробластов .................................................................
29
Протокол 2.6.3. Фиксация тканей для приготовления парафиновых
срезов................................................................................................................
30
Протокол 2.6.4. Предобработка препаратов рнказой А.......................... 31
Протокол 2.6.5. Предобработка препаратов пепсином........................... 31
Протокол 2.6.6. Предобработка препаратов протеиназой К ................. 31
Протокол 2.6.7. Постфиксация препаратов перед гибридизацией....... 32
Протокол 2.6.8. Мечение ДНК-зондов методом ник-трансляции......... 33
Протокол 2.6.9. Оптимизация размеров меченых фрагментов ............ 34
Протокол 2.6.10. Олигомечение ДНК со случайными праймерами .... 35
Протокол 2.6.11. Мечение зондов методом ПЦР...................................... 36
Протокол 2.6.12. Очистка ПЦР продукта ................................................. 37
Протокол 2.6.13. Использование вырожденных праймеров для
получения первичного амплификата (DOP-ПЦР) ..................................
38
Протокол 2.6.14. Получение меченых РНК зондов ................................. 39
Протокол 2.6.15. Оценка эффективности мечения зонда....................... 40
Протокол 2.6.16. Растворение зонда в гибридизационном буфере....... 42
Протокол 2.6.17. Отмывка препаратов после гибридизации................ 44
Протокол 2.6.18. Иммунохимическая детекция гибридизовавшегося
зонда .................................................................................................................
44
Таблица 2.2. Схема M-FISH на хромосомах человека с 6
флуорохромами ..............................................................................................
47
Таблица 2.3. Схема идентификации хромосом человека методом
репробинга с 3 флуорохромами ..................................................................
47
2.7. Флуоресцирующие белки................................................................................ 48
Таблица 2.4. Список клонированных флуоресцирующих белков ....... 49
Таблица 2.5. Некоторые варианты флуоресцирующих белков на
основе GFP ......................................................................................................
50
ГЛАВА 3. РЕГИСТРАЦИЯ И АНАЛИЗ ФЛУОРЕСЦЕНТНЫХ ИЗОБРАЖЕНИЙ .......................... 53
3.1. Фотографирование........................................................................................... 53
3.2. Цифровая система фиксации изображения ................................................... 54
3.3. Методы хранения и обработки цифровых изображений ............................. 56
ПРИЛОЖЕНИЯ ...................................................................................................................... 59
Приложение 1. Спектры флуорохромов .............................................................. 59
Приложение 2. Буферные растворы .................................................................... 66
1х PBS (ph 6,0)................................................................................................. 66
1х PBS (ph 6,8-7,2)........................................................................................... 66
20x SSC (ph 7,0)............................................................................................... 66
Ацетатный буфер (ph 4,2)............................................................................. 66
Фосфатный буфер Зёренсена (ph 5,5)......................................................... 66
Фосфатный буфер Зёренсена (ph 6,8)......................................................... 66
Буфер Макильвейна ph (6,8-7,0) ................................................................. 66
Буфер Макильвейна (ph 7,3)........................................................................ 66
ОГЛАВЛЕНИЕ....................................................................................................................... 67