31
5. После того как гель полностью затвердеет (через 30-45 мин при комнатной
температуре), осторожно удалите гребенку и поместите гель в электрофорезную
кювету.
6. Добавьте достаточное количество электрофорезного буфера (при необходимости
содержащего 0,5 мкг/мл бромистого этидия), так чтобы гель был закрыт слоем
буфера толщиной 1 мм.
7. Смешайте пробы с буфером для нанесения пробы, содержащим 5-10% глицерина,
7% сахарозы или 2,5% фикола и краситель (0,025% бромфенолового синего или
ксилолцианола) и внесите их в лунки геля под электрофорезный буфер. Обычно
буфер для нанесения проб готовят в виде раствора 6-10-кратной концентрации. Его
смешивают с пробой, а затем осторожно вливают в лунку с помощью
автоматической микропипетки.
8. Подсоедините электроды к источнику напряжения. Напряженность при проведении
разделения в агарозных гелях составляет 1-8 В/см. Маркерный краситель движется
с той же скоростью, что и фрагменты ДНК, содержащие указанные в табл. число
пар оснований.
9. По окончании разделения выньте пластинку с гелем из кюветы и поместите гель
вместе с пластинкой в красящий раствор (1 мкг/мл бромистого этидия). Будьте
осторожны! Гель хрупок и легко соскальзывает с пластинки. После 15 мин
прокрашивания выньте пластину вместе с гелем и промойте в воде в течение 20
мин.
10. Жидкость с пластинки удалите с помощью фильтровальной бумаги и переложите
пластинку на стекло Трансиллюминатора, пропускающее ультрафиолет.
Предостерижение. Работая с УФ-излучением необходимо предохранять глаза и
кожу от ожогов. Одевайте очки!