Каталог культур микроорганизмов

Подождите немного. Документ загружается.

РОССИЙСКАЯ АКАДЕМИЯ СЕЛЬСКОХОЗЯЙСТВЕННЫХ НАУК

RUSSIAN ACADEMY OF AGRICULTURAL SCIENCES

ГНУ ВСЕРОССИЙСКИЙ НАУЧНО-ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ

ИНСТИТУТ СЕЛЬСКОХОЗЯЙСТВЕННОЙ МИКРОБИОЛОГИИ

ALL-RUSSIA RESEARCH INSTITUTE

FOR AGRICULTURAL MICROBIOLOGY

КАТАЛОГ КУЛЬТУР

МИКРООРГАНИЗМОВ

• БАКТЕРИИ

• МИЦЕЛИАЛЬНЫЕ ГРИБЫ

• ДРОЖЖЕВЫЕ ГРИБЫ

CATALOGUE

OF MICROBIAL CULTURES

• BACTERIA

• FILAMENTOUS FUNGI

• YEASTS

Санкт – Петербург - Пушкин

St. Petersburg - Pushkin

2005

СОСТАВИТЕЛИ

РЕДАКЦИЯ КАТАЛОГА - академик РАСХН И.А.Тихонович, к.б.н. Ю.С.

Оследкин, зав. лабораторией типовых культур микроорганизмов.

Рецензент: академик РАСХН М.М. Левитин.

COMPILERS

EDITORS– academician RAAS Igor Tikhonovich, Yury Osledkin, Ph.D., Head of

Laboratory of Type Cultures of Microorganisms.

Reviewer: academician RAAS M.M. Levitin.

По бактериям: к.б.н. Оследкин Ю.С., н.с. Максимова Л.М.

По мицелиальным грибам: к.б.н. Кочетков В.В.

По дрожжевым грибам: к.б.н. Оследкин, н.с. Максимова Л.М.

По азотфиксирующим микроорганизмам: к.б.н. Васюк Л.Ф., к.б.н. Сафронова

В.И.

По энтомофильным культурам: к.б.н. Ермолова В.П.

Электронная версия каталога: к.т.н. Воробьев Н.И., к.б.н. Свиридова О.В.

Bacteria: Osledkin Yu., Ph.D.; Maksimova L., res.

Filamentous Fungi: Kochetkov V., Ph.D.

Yeast Fungi: Osledkin Yu., Ph.D.; Maksimova L., res.

Nitrogen-fixing Microogranisms: Vassiouk L., Ph. D.; Safronova V., Ph.D.

Enthomophyle Cultures: Ermolova V., Ph.D.

Electronic version for catalogue: Vorobyov N., Ph.D.; Sviridova O., Ph.D.

Издается по решению Ученого Совета института от 8 февраля 2005 г.,

протокол №1.

ГНУ ВНИИ сельскохозяйственной микробиологии Россельхозакадемии

All-Russia Research Institute for Agricultural Microbiology

ВНИИСХМ – аббревиатура коллекции

ARRIAM – abbreviation of Collection

196608, С-Петербург-Пушкин, шоссе Подбельского, 3.

196608, St-Petersburg - Pushkin, Podbelsky Sh., 3.

Тел./ Tel.: (812) 470-51-00; (812) 476-28-02

Факс/ Fax: (812) 470-43-62

E-mail: sviridova@arriam.spb.ru

Содержание

ВВЕДЕНИЕ ………………………………………………………………….. 4

Методы хранения …………………..…………………………………… 5

Оказываемые услуги пользователям ……………..………………… 5

Депонирование ………………………..………………………………… 5

КАТАЛОГ ШТАММОВ…………………………………..………………….. 8

Номенклатура…………………………………..………………………… 8

Правила пользования каталогом……………………………………… 8

Аббревиатуры коллекций и организаций .…………………………... 9

СПИСКИ …………………………………..…………………………………. 11

Список бактериальных культур ..……………………………………... 11

Список мицелиальных грибов .………………………………………… 40

Список дрожжевых грибов …….…………………...………………….. 67

Список питательных сред .…………………………….……………….. 71

БИБЛИОГРАФИЯ ……………………………………………………………. 83

CONTENTS

INTRODUCTION ……………………………………………………………... 6

Methods of storage……………………………………………………….… 6

Services for users …………………………………………………………. 7

Depositing ………………………………………………………………….. 7

CATALOGUE OF STRAINS …………………………………………………. 8

Nomenclature ……………………………………………………………….. 8

How to use the Catalogue …………………………………………………. 8

Abbreviations of Collections and Organizations …………………….…… 9

LISTS ……………………………………………………………………………. 11

List of Bacteria ………………………………………………………………. 11

List of Filamentous Fungi ……………………………………………..…… 40

List of Yeasts …………………………………………………………..……. 67

List of Culture Medias …………………………………………………….… 71

BIBLIOGRAPHY …………………………………………………………..…… 83

ВВЕДЕНИЕ

Коллекция культур микроорганизмов ГНУ ВНИИ сельскохозяйственной

микробиологии – одно из старейших и крупных специализированных хранилищ

непатогенных микроорганизмов России, существует с момента организации

института в 1930 году.

Началом коллекции послужили культуры рода Salmonella, с которыми

развернулись работы в 1891 г. во Временной бактериологической лаборатории

при Департаменте земледелия России. В дальнейшем пополнение

коллекционного фонда осуществлялось за счет культур, поступающих из

лабораторий института, а также в порядке обмена с коллекциями как СССР –

России, так и зарубежными.

В настоящее время коллекция микроорганизмов ГНУ ВНИИСХМ входит в

состав лаборатории типовых культур.

Основное направление работ:

• гарантированное поддержание и пополнение фонда;

• идентификация выделенных штаммов;

• подбор методов длительного поддержания жизнеспособности и

полезных свойств культур;

• обеспечение организаций и учреждений чистыми культурами для

научных и производственных целей.

Постановлением Правительства Российской Федерации в 1996 г.

коллекция определена как базовая для депонирования и хранения культур

непатогенных микроорганизмов сельскохозяйственного назначения.

Характеристика свойств и номенклатура поддерживаемых культур

отражает направление научных исследований, проводимых в институте в

области почвенной микробиологии, биологического азота, силосования кормов,

разработки микробиологических средств защиты растений. Так, ВНИИСХМ

располагает одной из лучших в мире, уникальной коллекцией клубеньковых

бактерий. В ее составе насчитывается 706 штаммов, относящихся к 36 видам

бобовых растений. Институт и его коллекция являются монопольным

держателем культур микроорганизмов – основы высокоэффективных

бактериальных препаратов битоксибациллина, бактокулицида, ризоторфина,

агрофила, флавобактерина, мизорина, а также ряда продуцентов для

биосинтеза аминокислот, витаминов, ферментов, органических кислот.

Методы хранения.

Для хранения и консервации микроорганизмов фонда коллекции

используется 4 группы методов: субкультивирование, лиофилизация, под

минеральным (вазелиновым) маслом и криоконсервирование при - 80º. Метод,

которым хранится каждый конкретный штамм, указан в каталоге в виде

буквенно-цифрового кода.

Оказываемые коллекцией услуги.

• Перечисленные в данном каталоге культуры выдаются организациям за

плату по гарантийному письму с указанием банковских реквизитов или с

предварительной оплатой счета. В запросе указывается коллекционный

номер требуемого штамма.

• Сервисные работы по идентификации и лиофилизации штаммов

осуществляются на основе договора-соглашения с заинтересованной

организацией или частным лицом.

• Консультации по методам длительного хранения культур.

Депонирование для целей патентной процедуры.

Депонирование культур в коллекции осуществляется за плату на основе

гарантийных писем с приложением двух экземпляров паспорта на культуру.

Паспорт подписывается всеми авторами и заверяется организацией,

направляющей культуру на депонирование. Если штамм не идентифицирован

до вида, представляется справка о непатогенности культуры.

Вопрос о депонировании рассматривается в течение 10 дней. Депозитор

представляет в коллекцию 5 пробирок культуры на агаровой среде и 25 ампул

лиофилизированной культуры с подробным описанием в паспорте методов

хранения и прописью питательных сред. Культура при поступлении в

коллекцию проверяется на чистоту, жизнеспособность и после положительного

решения о депонировании депозитору выдается соответствующая справка.

Коллекция, в соответствии с общепринятой мировой практикой, не несет

ответственности за свойства и/или активность депонированного штамма.

INTRODUCTION

Microoganisms cultures collection of All-Russia Research Institute for

Agricultural Microbiology (ARRIAM) is one of long standing and specialized

repositories of non-pathogenic microorganisms in Russia. It exists just from a

moment of foundation of the Institute in 1930.

Cultures of the species Salmonella marked the beginning of Collection. Works

with them have launched in 1891 at the Temporary Bacteriological Laboratory of

Agricultural Department of Russia. Subsequently stock of Collection was replenished

by cultures from the laboratories of the Institute and also supplied on the exchange

basis by other collections both Russian (earlier – Soviet) and foreign.

At present Collection of microorganisms of ARRIAM is included in the

Laboratory of Type Cultures.

Main directions of activity:

• Guaranteed maintenance and replenishment of Collection;

• Identification of selected strains;

• Choice of the techniques for preservation of viability and useful properties of

cultures;

• providing organizations and institutions with for research and production

purposes.

Resolution of Government of Russian Federation in 1966 determined the

Collection as a basis for deposition and storage of non-pathogenic microorganisms

cultures of agricultural purposes.

Description of properties and nomenclature maintained cultures reflects the

direction of scientific research which are conducted at the Institute in the area of soil

microbiology, biological nitrogen, silaging of fodder, elaboration of microbiological

means of plant protection.

Thus, ARRIAM disposes of one of the world-wide exceptional collection of

nodule bacteria. It consists of 706 strains related with 36 species of Legume plants.

Institute and its collection are monopoly holder of cultures of microorganisms-

producers of highly effective bacterial preparations – Bitoxibacillin, Bactoculicid,

Rhizotorfin, Agrophyl, Flavobacterin, Mizorin as well number of the producers of

aminoacides, vitamins, enzymes, organic acids biosyntesis.

Methods of storage.

For storage and preservation of microorganisms of fund of a collection 4 groups

of methods are used: subcultivation, liophilisation, under mineral (vaseline) oil and

cooling conservation at - 80º. The method by which everyone is stored concrete

strain, is specified in the catalogue as an alphanumeric code.

Services, rendered by the Collection.

• The cultures listed in the Catalogue may be assigned to any organizations after

receiving a letter of guarantee stating their bank account or by means of advance

payment. Catalogue number of required strain must be specified in the

application.

• Services on identification and lyophilization are delivered on the basis of contract-

agreement between the Institute and interested organization or private person.

• Consulting on techniques of preservation and storage of cultures.

Depositing for patent procedure

Depositing of cultures is done on the basis of letter of guarantee and two copies

of culture passport. Passport must be signed by all the authors and sealed by stamp

of organization, which deliver the culture for depositing. If strain is not identified up to

species it is necessary to deliver a certificate of non-pathogenity of the culture.

Request on depositing is considered during 10 days. Depositor must deliver to

Collection 5 test-tuber with culture and the detailed description of storage methods

and nutrient media prescription in the passport. Prior to the depositing the culture is

checked for purity, viability and in case of positive decision of depositing depositor is

informed by appropriate reference. According to a generally accepted world practice

the Collection does not bear the responsibility for properties and/or efficiency of

deposed strain.

КАТАЛОГ ШТАММОВ

Настоящий каталог включает 660 штаммов бактерий, мицелиальных и

дрожжевых грибов. В перечне штаммов не указываются культуры,

депонированные в коллекции в целях патентной процедуры, а также многие

культуры, поддерживаемые в рабочих коллекциях ряда лабораторий ВНИИ

сельскохозяйственной микробиологии.

Номенклатура.

Научные названия бактерий, перечисленные в данном каталоге, указаны

в соответствии с принятыми положениями номенклатуры этих

микроорганизмов. Списки действительных (валидных) наименований бактерий

постоянно публикуются в журнале International Journal of Systematic Bacteriology

(IJSB). Если правильное, видовое название не известно, то в названии, вместо

видового эпитета ставится «sp.».

Номенклатура мицелиальных грибов основана на Международном

кодексе ботанической номенклатуры и общих фундаментальных работах по

микологии, а также публикациях в таких периодических изданиях, как:

Mycological Papers – U.K. и Studies in Mycology – The Netherlands. Номенклатура

дрожжевых грибов дается согласно основному руководству и с учетом новых

публикаций.

Правила пользования каталогом.

Латинские названия таксонов расположены в алфавитном порядке,

штаммы одного вида перечисляются по их возрастающим номерам в

коллекции.

Ниже приведены примеры записи информации о коллекционных

штаммах:

1. название рода, вида;

2. автор(ы), описавший(ие) и переописавшиевид (подвид), и год

публикации (для бактерий год валидации согласно спискам

одобренных наименований); в некоторых случаях указывается также

вариант (для грибов), или биовар (для бактерий);

3. обозначение группы микроорганизмов – B – бактерии, F –

мицелиальные грибы, Y – дрожжевые грибы;

4. номер штамма в коллекции, если штамм типовой для данного таксона

ставится символ «Т»;

5. коллекция (приводится ее аббревиатура) лицо и/или организация,

откуда получен штамм, под каким номером или обозначением

передавался, движение штамма в хронологическом порядке передач

указывается стрелкой;

6. название, под которым штамм был получен коллекцией;

7. синонимы;

8. источник выделения штамма;

9. особые свойства штамма;

10. номер питательной среды, соответствующий списку питательных сред;

11. температура культивирования штамма;

12. библиографическая ссылка, соответствующая номеру списка

библиографии.

Аббревиатуры и использованные сокращения:

БНИИЗ - Белорусский НИИ земледелия

БСХА - Белорусская Сельскохозяйственная Академия

ВНИИЗиК - ВНИИ зернобобовых и крупяных культур, Россия

ВНИИС - ВНИИ сои, Россия

ИМВ - Институт микробиологии и вирусологии, Украина

ИНМИА - Институт микробиологии, Армения

ИНМИБ - Институт микробиологии, Белоруссия

ИСХСВ - Институт сельского хозяйства, Северный Вьетнам

ИПЮ - Институт почвоведения, Югославия

КСХОС - Карельская сельскохозяйственная опытная станция

ЛСХА - Латвийская Сельскохозяйственная Академия

НБС - Новосибирский ботанический сад

НИСХИИ - Национальный институт сельскохозяйственный исследований,

Индия

ОММ - Отдел микробиологии АН Молдавии

ПУИ - Политехнический Университет, Испания

СМА - Сектор микробиологии АН Армении

СХИНЗ - Сельскохозяйственный институт нечерноземной зоны, Россия

УНИИСХМ - Украинский НИИ сельскохозяйственной микробиологии

УНИИЗ - Украинский НИИ земледелия

УХФ - Университет Хельсинки, Финляндия

ЭНИИЗ - Эстонский НИИ земледелия

ЦБСБ - Центральный ботанический сад, Белоруссия

IMG – Institute of Molecular Genetics, RAS, Kurchatov Sq., 46, Moscow, 123182,

Russia

INA –Institute of New Antibiotics, 119867, Moscow, B. Pirogovskaya St., 11, Russia

KSM – Collection of Genetical Strains of Bacteria, Institute of Epidemiology and

Microbiology named after N.F.Gamalei, AMS. 123098, Moscow, Gamalei Str.,

18, Russia.

LIA – Institute of Antibiotics and Enzymes. 198020, St. Petersburg, av.

Ogorodnikova, 41, Russia

RIA – Research Institute for Antibiotics. 113105, Moscow, Nagatinskay St., 3f,

Russia

VKM – All-Russian Collection of Microorganisms, Institute of Biochemistry and

Physiology of Microorganisms, Russian Academy of Sciences, 142292,

Pushchino, Moscow Region, Russia

" " - устаревшее название

МДА - маннитно-дрожжевой агар

TY - триптоно-дрожжевая среда

СЖА - сахарозо-желатиновый агар

С-1 - штаммы хранятся в герметично-закрытых стеклянных флаконах с

полужидким МДА (пересев через 2 года)

С-2 - штаммы хранятся на косяках с МДА (пересев через 6 месяцев)

К - штаммы хранятся при – 20

С в среде TY с 10% глицерином

Л - штаммы хранятся в лиофилизированном состоянии в СЖА при -20

С.