Горбунова В.Н., Савельева-Васильева Е.А., Красильников В.В. Молекулярная неврология. Заболевания нервно-мышечной системы

Подождите немного. Документ загружается.

— дупликация: дублирование сегмента ДНК.

— инверсия: переворот на 180° сегмента ДНК.

— инсерция: вставка сегмента ДНК.

— молчащая (нейтральная или полиморфная): мутация, не

имеющая фенотипического выражения.

— миссенс: замена нуклеотида в кодирующей части гена,

приводящая к замене аминокислоты в соответствующем бел-

ковом продукте.

— нонсенс: замена нуклеотида в кодирующей части гена,

сопровождающаяся образованием стоп-кодона и прекраще-

нием трансляции.

— регуляторная: мутация в 5'или в З'-нетранслируемых об-

ластях гена, нарушающая регуляцию работы гена.

— со сдвигом рамки считывания (фреймшифт): мутация,

приводящая к сдвигу считывания триплетов в процессе транс-

ляции полипептидной цепи.

— сплайсинговая: мутация, затрагивающая сайты сплайсин-

га или создающая новые сайты сплайсинга в интронных об-

ластях гена.

— точечная: мутация, затрагивающая от одного до несколь-

ких нуклеотидов.

— транзиция: точечная замена пиримидина на другой пи-

римидин или пурина на другой пурин.

— трансверсия: точечная замена пиримидина на пурин и

наоборот.

Неравновесие по сцеплению: неслучайное распределение в га-

метах комбинации аллелей двух локусов одной хромосомы в

определенной популяции.

Нозерн блот-гибридизация: метод идентификации молекул РНК,

содержащих комплементарные ДНК-зонду последовательно-

сти, среди электрофоретически разделенных РНК, фиксиро-

ванных на твердом матриксе (нитроцеллюлозных или нейло-

новых фильтрах).

Нуклеаза S1: фермент деградации однонитевых ДНК.

Олигонуклеотиды: небольшие однонитевые молекулы ДНК.

311

ПДРФ (полиморфизм длины рестрикционных фрагментов):

внутривидовая изменчивость подлине фрагментов геномной

ДНК, образующихся после воздействия специфической эн-

донуклеазой.

— ПДРФ-анализ: исследование методами блот гибридиза-

ции или ПЦР частоты встречаемости полиморфного сайта ре-

стрикции среди определенной группы людей или в популя-

ции.

Первичный биохимический дефект: белковый продукт гена, му-

тации в котором вызывают наследственное заболевание.

Плазмиды: небольшие кольцевые двухцепочечные молекулы ДНК,

способные к автономной репликации, которые могут присут-

ствовать в различном числе копий в бактериальных клетках;

часто используются в качестве векторных молекул.

Плейотропизм: множественные фенотипические изменения, вы-

званные мутацией одного гена.

Повторы (ДНК): последовательности ДНК, многократно встречаю-

щаяся в геноме.

— сателлитные: относительно короткие, не превышающие

200 пар оснований, высокоповторяющиеся последовательно-

сти ДНК, расположенные тандемными блоками и занимаю-

щие около 10% генома.

— микро-: сателлитные ДНК с длиной повторяющегося эле-

мента в диапазоне от 1 до 4 нуклеотидов;

— мини-: сателлитные ДНК с длиной повторяющегося эле-

мента в диапазоне от 5 до 100 нуклеотидов.

Alu: последовательности ДНК размером около 300 п.о., повторен-

ные в геноме человека несколько сотен тысяч раз; содержат

сайт рестрикции для фермента Alul, имеют характерную ди-

мерную структуру и фланкированы прямыми повторами дли-

ной от 7 до 20 п.о.

Позиционное клонирование: молекулярные методы поиска и иден-

тификации гена в заданной цитогенетической области.

— прогулка и прыжки по хромосоме: методы позиционно-

го клонирования, основанные на последовательном поиске

генных последовательностей среди клонированных перекры-

вающихся фрагментов ДНК из области локализации гена.

312

Полимеразная цепная реакция (ПЦР) или специфическая амп-

лификация ДНК: избирательный синтез in vitro большого чис-

ла копий (порядка миллиона) небольшого фрагмента ДНК

размером обычно от 50 до нескольких тысяч нуклеотидов по

матричной молекуле ДНК.

— ассиметричная: амплификации, при которой концентра-

ция одного из олигопраймеров значительно превосходит кон-

центрацию другого праймера, в результате чего синтезиру-

ется преимущественно только одна цепочка ДНК.

— количественная: ПЦР, дополненная количественной оцен-

кой результатов амплификации.

— мультиплексная: одновременная амплификация несколь-

ких участков матричной ДНК.

— обратная (RT-PCR): ПЦР, при которой в качестве матрич-

ной ДНК используется кДНК, полученная путем обратной

транскрипции эктопической мРНК либо мРНК, изолирован-

ной из экспрессирующих тканей.

Полиморфизм: генетическая изменчивость локуса в определен-

ной популяции.

Пренатальная диагностика: диагностика состояния плода в пери-

од внутриутробного развития.

—доимплантационная: диагностика состояния зародыша на

стадии развития, предшествующей его имплантации в стенку

матки.

— молекулярная: основанная на использовании методов

ДНК—диагностики.

— косвенная: идентификация мутантных хромосом в се-

мьях высокого риска и у плода с помощью молекулярных мар-

керов.

— прямая: молекулярная идентификация мутаций в семь-

ях высокого риска и у плода.

Праймеры: необходимые для проведения полимеразной цепной

реакции небольшие однонитевые молекулы ДНК, комплемен-

тарные З

концам амплифицируемого участка на смысловой

и антисмысловой нитях ДНК.

313

Промотор: основной регулятор работы гена; расположен в 5'-не-

транслируемой области; место взаимодействия ДНК с РНК-

полимеразой.

Псевдогенгмутационно измененная последовательность ДНК, име-

ющая высокую степень гомологии с функциональным геном,

но неспособная транскрибироваться или продуцирующая не-

активный генный продукт.

Рамка считывания: нуклеотидная последовательность, выражен-

ная в кодирующих триплетах, начинающаяся со стартового

кодона и заканчивающаяся нонсенс-кодоном.

— закрытая: рамка считывания, внутри которой в результа-

те мутации возник стоп-кодон.

— открытая (ORF): участок молекулы ДНК между иницииру-

ющим и стоп-кодонами.

— сдвиг рамки считывания: мутация, приводящая к сдвигу

считывания триплетов в процессе трансляции полипептидной

цепи.

Рестриктаза (эндонуклеаза): фермент бактериального происхож-

дения, разрезающий на фрагменты двунитевую молекулу ДНК

в местах, соответствующих специфической последователь-

ности из 4—12 нуклеотидов.

— сайт рестрикции: специфическая последовательность из

4—12 нуклеотидов, узнаваемая эндонуклеазой; место взаи-

модействия рестриктазы с ДНК.

Рекомбинация (кроссинговер): обмен участками гомологичных

хромосом в процессе мейоза.

— гомологичная: рекомбинация между гомологичными уча-

стками хромосом.

— негомологичная: рекомбинация между негомологичны-

ми участками хромосом.

Репарация: исправление дефектов синтеза ДНК.

Репликация: осуществляемый с помощью ДНК-полимеразы син-

тез комплементарных нитей ДНК по матричной молекуле

ДНК; процесс самовоспроизводства молекул ДНК.

Репрессия (гена): ферментативное ингибирование транскрипции

или трансляции.

314

Рибонуклеиновая кислота (РНК): нитевидная молекула, в кото-

рой остов из чередующихся остатков рибозы и фосфорной

кислоты ковалентно соединен с 4 азотистыми основаниями,

расположенными в варьирующем порядке — аденином, ура-

цилом, гуанином и цитозином.

— матричная (мРНК): молекулы РНК, состоящие из после-

довательностей, комплементарных экзонам генов; образуют-

ся в результате сплайсинга и концевых модификаций из мо-

лекул первичного РНК-транскрипта;

— эктопическая (незаконная) мРНК: мРНК, присутству-

ющая в специализированных клетках в следовых количест-

вах.

— РНК-транскрипт (первичный): молекулы РНК, образую-

щиеся в процессе транскрипции.

— транспортные (тРНК): 20 участвующих в процессе транс-

ляции молекул РНК, каждая из которых способна транспор-

тировать только одну аминокислоту, что определяется в точ-

ном соответствии с генетическим кодом структурой антико-

дона.

— рибосомальные (рРНК): молекулы РНК, входящие в со-

став рибосом.

РНК-полимераза: фермент комплементарного синтеза РНК по

матрице ДНК.

Сайт: определенное место в молекулах ДНК, РНК или белка, обла-

дающее специфической функцией.

Сантиморган (сМ): единица измерения генетического расстояния;

два гена, локализованные в одной хромосоме, находятся на

расстоянии 1 сМ друг от друга, если вероятность рекомбина-

ции между ними в процессе мейоза составляет 1%.

Секвенирование: определение нуклеотидной последовательности

молекулы ДНК.

Синтения: сходный порядок расположения ортологичных генов на

определенных участках хромосом у разных видов организ-

мов.

Соматические гибриды: гибридные клетки, образующиеся в ре-

зультате искусственного слияния диплоидных клеток разно-

го видового происхождения; техника соматической гибриди-

315

зации используется для определения хромосомной принад-

лежности отдельных генов или групп сцепления.

Сплайсинг: процесс вырезания последовательностей, компле-

ментарных интронам, из молекулы первичного РНК-транс-

крипта.

—альтернативный: тканей эмбриоспецифические различия

по характеру вырезания интронов одного и того же гена при

процессинге мРНК.

— сайт сплайсинга: каноническая последовательность ди-

нуклеотидов, расположенная на границе экзон-интронных об-

ластей; необходима для правильного сплайсинга.

—донорный: последовательность GT

расположенная в на-

чале интрона.

— акцепторный: последовательность AG, расположенная

в конце интрона.

Тотипотентность: способность эмбриональных клеток дифферен-

цироваться во все типы клеток взрослого организма.

Трансген: чужеродный ген, искусственно введенный в культивиру-

емые клетки или в ранние зародыши.

Трансгеноз: искусственный межили внутривидовой перенос генов

в составе определенных генетических конструкций.

Трансгенные животные: экспериментальные животные, получен-

ные в результате искусственного введения чужеродных ге-

нетических конструкций или целых клеток в оплодотворен-

ную яйцеклетку или в ранние зародыши млекопитающих с по-

следующей их пересадкой псевдобеременным самкам.

— «нокаут» мыши: модельные трансгенные животные с вы-

ключенным геном-мишенью; выключение гена достигается за

счет направленного разрушения отдельных экзонов (так на-

зываемые нулевые варианты) либо путем сайт-специфичес-

кого введения определенных мутаций.

— химера: трансгенное животное, состоящее из клеточных

клонов двух разных типов: клеток исходного родительского

генотипа и введенных в зародыш тотипатентных эмбриональ-

ных стволовых клеток.

— зародышевые трансмиттеры: химерные животные, у

которых транфецированные в зародыш эмбриональные ство-

316

ловые клетки дифференцировались в половые клетки и дали

начало полноценным зрелым гаметам.

Трансдукция: введение экзогенных ДНК с помощью фаговых век-

торов.

Транскрипция: синтез молекул первичного РНК-транскрипта, ком-

плементарных определенным участкам молекулы ДНК (ге-

нам).

—альтернативная: экспрессия гена с разных промоторов в

процессе онтогенетической дифференцировки тканей и в раз-

ных специализированных клетках организма.

— обратная: комплементарный синтез ЦИК по матрице РНК.

Транскрипционная система: искусственно сконструированная

бесклеточная система, обеспечивающая возможность син-

теза и процессинга первичного РНК-транскрипта in vitro.

Транскрипционный фактор: фермент активации и/или репрессии

генной активности, способный взаимодействовать с молеку-

лами ДНК.

Трансляция: синтез полипептидной цепи по молекуле мРНК.

Трансляционная система: искусственно сконструированная бес-

клеточная система, обеспечивающая возможность трансля-

ции и процессинга белков in vitro.

Транспозон: мобильный элемент генома, способный менять свою

внутрихромосомную локализацию.

Трансфекция: процесс введения экзогенной ДНК в эукариотичес-

кие клетки.

Трансформация: введение плазмидной ДНК в бактериальные

клетки.

— ко-трансформация: одновременное введение в бактери-

альные клетки плазмиды и сегмента чужеродной ДНК.

Улавливание экзонов (exon trapping): функциональная диагнос-

тика генов, основанная на идентификации открытых рамок

считывания, промоторных участков, сайтов сплайсинга, поли-

А сигнальных последовательностей.

Хромосомы: локализованные в ядрах структуры, содержащие су-

перскрученные за счет взаимодействия с гистоновыми бел-

ками молекулы ДНК.

— аутосомы: неполовые хромосомы.

317

— гаплоидный (набор хромосом): набор хромосом поло-

вых клеток, состоящий из всех аутосом и одной из половых

хромосом (X или Y).

— диплоидный (набор хромосом): двойной набор хромо-

сом соматических клеток; в кариотипе женщин наборы ауто-

сом и Х-хромосом гомологичны друг другу, в кариотипе муж-

чин наряду с двумя гомологичными наборами аутосом при-

сутствует по одной X и Y хромосоме.

— половые: X и Y хромосомы; в кариотипе особей разного

пола набор половых хромосом различен (XX — женский пол,

XY — мужской)

Экзон: кодирующий участок гена.

Экспрессионная система: модифицированная клеточная культу-

ра (бактериальная, дрожжевая или эукариотическая) с экс-

прессией трансгена.

Экспрессия: активированное состояние гена, то есть способность

к транскрипции и трансляции.

Элемент генома: участок ДНК, дифференцируемый по функцио-

нальному признаку или по композиции нуклеотидных осно-

ваний.

— мобильный: элемент генома, топография и количество кото-

рого может варьировать в различных клетках, тканях и у раз-

ных индивидуумов.

Эмбриональные стволовые клетки (ЭСК): тотипатентные куль-

туры клеток, устанавливаемые из бластоцисты (внутренней

клеточной массы) или из первичных половых клеток ранних

постимплантационных зародышей; клеточный вектор.

Эндоцитоз: проникновение какого-либо вещества или частицы

внутрь клетки путем впячивания клеточной мембраны.

Эписома: внехромосомная суперскрученная кольцевая эукарио-

тическая молекула ДНК.

Эффект основателя: распространение вновь возникшей мутации

в генетическом изоляте.

СЕРН-коллекции родословных: перевиваемые культуры клеток

от членов обширных семей, родословные которых насчиты-

вают сотни человек. Коллекции созданы в Центре по изуче-

нию полиморфизма человека во Франции.

318

COS-клетки: модифицированная культура фибробластов почек

африканской зеленой мартышки, обеспечивающая высокий

уровень экспрессии внехромосомных трансфецированных

генетических конструкций.

CpG островки: последовательности ДНК от 500 до 2000 и.о., пред-

ставленные в виде кластеров неметилированных CpG дупле-

тов и G/C боксов.

EST (expressed sequnce tag): короткие секвенированные после-

довательности ДНК, изолированные из кДНКовых библиотек

генов.

MIM: шестизначный номер, соответствующий отдельному менде-

лирующему локусу в каталоге генов человека МакКьюсика.

STS (sequence tagged sites): короткие секвенированные последо-

вательности ДНК с известной геномной локализацией.

В. Н. ГОРБУНОВА

Е. А. САВЕЛЬЕВА-ВАСИЛЬЕВА,

В. В. КРАСИЛЬНИКОВ

МОЛЕКУЛЯРНАЯ НЕВРОЛОГИЯ

Часть I

ЗАБОЛЕВАНИЯ

НЕРВНО-МЫШЕЧНОЙ

СИСТЕМЫ

Корректор

Комарова Л.Н.

Дизайн обложки

Романова Н.Ф.

Верстка

Романова Н.Ф.

ISBN 5-89720-026-2

Изд. лиц. № 065259 от 30 июня 1997 г.

Подписано в печать 30.06.2000. Формат 60x88/16

Печать офсетная. Гарнитура «AGLetterica». Усл. печ. л. 20

Тираж 1000 экз. Заказ 170.

Издательство «Интермедика»

194100, Санкт-Петербург, а/я 8

e-mail: intmedic@mail.wplus.net

Отпечатано в ГИПП "Искусство России"

198099, Санкт-Петербург, ул. Промышленная, д. 38, к. 2