Диссертация на соискание ученой степени доктора химических наук. —
Черноголовка, ИФАВ РАН, 2013. — 324 с.
Специальность 02.00.03 – органическая химия; 02.00.04 – физическая
химия
Цель исследования: Разработка количественных моделей «структура –
свойство» и «структура – активность» с использованием дескрипторов
водородной связи и других молекулярных дескрипторов для
компьютерного дизайна органических соединений, включая
прогнозирование физико-химических свойств и биологической
активности неисследованных соединений и предсказание новых структур
с заданными свойствами.
Современное состояние в области создания количественных
моделей «структура – свойство» и «структура – активность» (на
примере острой токсичности органических соединений)
Общая схема QSPR/QSAR моделирования
Объекты исследования и источники данных
Дескрипторы
Кластеризация молекул. Предобработка данных
Отбор дескрипторов
Статистические методы моделирования
Валидация моделей
Модели
Экспертные системы
Экспериментальная часть
Физико-химические данные
Биологические данные
Расчет, преобразование и отбор дескрипторов
Меры сходства химических соединений
Статистические методы исследования
Валидация QSPR/QSAR моделей
Методика проведения спектральных и калориметрических измерений
Планирование эксперимента и оценка термодинамических параметров водородной связи по данным экспериментальных измерений
Исходные вещества, реактивы и их квалификация
Количественные модели «структура – физико-химические свойства» органических соединений
Аддитивно-мультипликативная модель энтальпии и свободной энергии водородной связи. Монофункциональные соединения
Аддитивно-мультипликативная модель энтальпии и свободной энергии водородной связи. Полифункциональные соединения
Модель липофильности органических соединений
Компьютерный программный комплекс HYBOT
Выводы по главе
Количественные локальные модели «структура – биологическая активность» органических соединений
Классификационные и регрессионные модели неполярного наркоза
Классификационные и регрессионные модели полярного наркоза
Линейный дискриминантно - регрессионный подход
Ретардантная активность солей четвертичного аммония
Выводы по главе
Количественные глобальные модели «структура – биологическая активность» органических соединений
Модель АЛБT
Модель AMP
Модель ЛРМПК
Проницаемость ФАВ через гематоэнцефалический барьер
Выводы по главе
Перспективные разработки в области создания количественных моделей «структура – свойство» и «структура – активность»
Рекуррентная модель
Фрактальный дескриптор
Линейная динамическая модель
Выводы по главе
Заключение
Список литературы
Общая схема QSPR/QSAR моделирования
Объекты исследования и источники данных
Дескрипторы
Кластеризация молекул. Предобработка данных
Отбор дескрипторов
Статистические методы моделирования
Валидация моделей
Модели
Экспертные системы
Экспериментальная часть
Физико-химические данные
Биологические данные
Расчет, преобразование и отбор дескрипторов
Меры сходства химических соединений
Статистические методы исследования
Валидация QSPR/QSAR моделей
Методика проведения спектральных и калориметрических измерений
Планирование эксперимента и оценка термодинамических параметров водородной связи по данным экспериментальных измерений
Исходные вещества, реактивы и их квалификация
Количественные модели «структура – физико-химические свойства» органических соединений
Аддитивно-мультипликативная модель энтальпии и свободной энергии водородной связи. Монофункциональные соединения
Аддитивно-мультипликативная модель энтальпии и свободной энергии водородной связи. Полифункциональные соединения
Модель липофильности органических соединений
Компьютерный программный комплекс HYBOT
Выводы по главе
Количественные локальные модели «структура – биологическая активность» органических соединений
Классификационные и регрессионные модели неполярного наркоза
Классификационные и регрессионные модели полярного наркоза
Линейный дискриминантно - регрессионный подход
Ретардантная активность солей четвертичного аммония
Выводы по главе
Количественные глобальные модели «структура – биологическая активность» органических соединений
Модель АЛБT
Модель AMP
Модель ЛРМПК
Проницаемость ФАВ через гематоэнцефалический барьер
Выводы по главе
Перспективные разработки в области создания количественных моделей «структура – свойство» и «структура – активность»
Рекуррентная модель
Фрактальный дескриптор
Линейная динамическая модель
Выводы по главе
Заключение
Список литературы